La Federación Peruana de Fútbol- FPF- dejó de reconocerlo como presidente íntimo, debido a que fue separado como socio de la institución blanquiazul por la Junta Calificadora y de Disciplina, en diciembre de 2009.
Mediante el oficio número 693-FPF-2012, la autoridad deportiva señala que el socio Julio César Arango Ortiz debe ser restituido como vicepresidente del Consejo Directivo y deberá asumir la presidencia del club en reemplazo de Alarcón.
Finalmente la FPF invocó al club Alianza Lima a solucionar sus problemas institucionales a través de una Asamblea General de Asociados.